Valizadeh, M.,  F. Tahvildar Biderouni, S. R. Shahrokhi, M. Ghanimatdan & A. R. Nagahi, 2021. Sequencing and phylogenetic analysis of mitochondrial cox1 and nad1 genes in Toxocara canis and Toxascaris leonina isolates from Iran. Bulg. J. Vet. Med., 24, No 2, 251-260.

 

DOI: 10.15547/bjvm.2274

 

Toxocara canis and Toxascaris leonina are the most important ascaridoid nematodes of the family Toxocaridae. The present study was aimed to characterisation and analysis of genetic variation within and among T. canis and T. leonina isolates obtained from Iran by sequencing partial mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (pcox1) and partial NADH dehydrogenase subunit 1 (pnad1) genes. A total number of 134 adult nematodes belonging to Toxocaridae family were collected from stray dogs in Alborz province, Iran during 2015 and 2016. Polymerase chain reaction (PCR) was performed and products were sequenced. Sequences of two mitochondrial cox1 and nad1 genes were compared with other sequences in the GenBank, while multiple sequences alignment analysis was performed using the Bioedit and MEGA6 software and phylogenetic tree was plotted. For all isolates, amplicons of about 450 and 350 base pairs (bp) were successfully produced by PCR for cox1 and nad1, respectively. All sequences of T. canis isolates from present study were 100% homologous across the nad1 gene but not in the cox1 gene. The results indicate that the PCR method based on sequence of cox1 and nad1 genes is a suitable technique for the differentiation of T. canis and T. leonina species and that mtDNA regions could be used as genetic markers for the identification and differentiation of Toxocara species.

 

Key words: cox1, Iran, mtDNA, nad1, Toxocara canis, Toxascaris leonina

 

Valizadeh, M.,  F. Tahvildar Biderouni, S. R. Shahrokhi, M. Ghanimatdan & A. R. Nagahi, 2021. Секвениране и филогенетичен анализ на митохондриалните гени cox1 и nad1 при изолати Toxocara canis и Toxascaris leonina от Иран. Bulg. J. Vet. Med., 24, No 2, 251-260.

 

DOI: 10.15547/bjvm.2274

 

Toxocara canis и Toxascaris leonina са най-важните аскаридни нематоди от семейство Toxocaridae. Това изследване бе проведено за характеризиране и анализ на генетичната вътре- и междувидова вариация  при T. canis и T. leonina изолати от Иран чрез секвениране на част от гените на митохондриалната субединица 1 на цитохром с оксидазата  (pcox1) и част на субединица 1 на NADH дехидрогеназа (pnad1). Общо  134 възрастни нематоди от семейство Toxocaridae бяха събрани от бездомни кучета в провинция Алборз, Иран през 2015 и 2016. Бе извършен PCR анализ, а продуктите бяха секвенирани. Секвенциите на двата митохондриални гена cox1 и nad1 бяха сравнени с други секвенции от GenBank, а анализ за подравняване на множество секвенции бе извършен посредством Bioedit и MEGA6 софтуер и бе конструирано филогенетично дърво. За всички изолати, ампликони с големина около 450 и 350 bp бяха получени при PCR съответно за cox1 и nad1. Всички секвенции на изолатите T. canis от това проучване бяха 100% хомоложни за nad1 но не и за cox1 гена. Резултатите показват, че PCR методът базиран върху последователностите на гените сox1 и nad1 е подходящ за диференциране на видовете T. canis и T. leonina, и че областите от mtDNA могат да се използват като генетични маркери за идентифициране и диференциране на видовете Toxocara.

 

Ключови думи: cox1, Иран, mtDNA, nad1, Toxocara canis, Toxascaris leonina