Gencheva, D., 2020. Single nucleotide polymorphism of the β-lactoglobulin gene in sheep breeds reared in Bulgaria. Bulg. J. Vet. Med., 23, No 3, 295-303.

 

DOI: 10.15547/bjvm.2235

 

In the present study, single nucleotide polymorphism in exon II of the β-lactoglobulin gene was investigated in four Bulgarian sheep breeds: Bulgarian Dairy Synthetic Population sheep (BDSP), Copper-red Shumen sheep (CRSH), Stara Zagora sheep (STZG) and Pleven Blackhead sheep (PLBH). Two genetic variants of β-LG gene (A and B) have been identified through PCR-RFLP assay. A 103 bp fragment of the polymorphic β-LG locus were amplified and digested with endonuclease enzyme RsaI. The obtained restriction fragments revealed three genotypes: AA, AB and BB, observed in 31%, 65.5% and 3.5% of the BDSP population and in 48%, 28% and 24% of CRSH sheep population, respectively, with departure from the Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05) in these groups. The allele frequencies demonstrated a prevalence of the A allele (0.638 and 0.620) over the B allele (0.362 and 0.380) in both populations. On the contrary, the distribution of allele frequencies in STZG and PLBH was 0.240 and 0.100 for allele A, respectively and 0.760 and 0.900 for allele B. Therefore, the homozygous BB genotype in these sheep populations was more frequently encountered (0.520 and 0.800) than the heterozygous AB genotype (0.480 and 0.200), with HWE correspondence (P>0.1). The homozygous genotype AA was absent in STZG and PLBH sheep populations. The greatest Nei’s genetic distance calculated by UPGMA method was found between the populations BDSPand PLBH (0.5334), while the closest relationship (0.0006) was established between CRSH and BDSP. The results obtained from the present investigation confirmed the presence of the SNP polymorphism in exon II of the β-lactoglobulin gene. Therefore, the genetic variability established in this polymorphic locus could be applied in further association studies with milk production traits in sheep.

Key words: Bulgarian sheep breeds, β-lactoglobulin gene, PCR-RFLP analysis, single nucleotide polymorphism

 

Генчева, Д., 2020. Единични нуклеотидни полиморфизми на β-лактоглобулиновия ген при породи овце, отглеждани в България. Bulg. J. Vet. Med., 23, No 3, 295-303.

 

DOI: 10.15547/bjvm.2235

 

В това проучване бе изследван единичният нуклеотиден полиморфизъм в екзон II на β-лактоглобулиновия (LG) ген при 4 български породи овце: Синтетична популация българска млечна (СПБМ), Медночервена шуменска овца (МЧШ), Старозагорска овца (СЗ) и Плевенска черноглава овца (ПЧ). Идентифицирани са 2 генетични варианта на β-LG ген (A и B) чрез PCR-RFLP анализ. Амплифициран бе 103 bp фрагмент на полиморфния β-LG локус, и дигестиран с ендонуклеазата RsaI. Получените рестрикционни фрагменти разкриха 3 генотипа: AA, AB и BB, наблюдавани при 31%, 65.5% и 3.5% на популацията СПБМ и при 48%, 28% и 24% от МЧШ овце с отклонение от равновесието на Харди-Вайнберг (P<0.05) при тези групи. Честотите на алелите показаха преобладаване на алел A (0.638 и 0.620) над алел B (0.362 и 0.380) в двете популации. За разлика от тях, разпределението на алелните честоти при СЗ и ПЧ овца бе съответно 0.240 и 0.100 за алел A, и 0.760 и 0.900 за алел B. Следователно, хомозиготният генотип BB при тези породи овце се срещаше по-често (0.520 и 0.800) от хетерозиготния AB генотип (0.480 и 0.200), в съответствие с равновесието на Харди-Вайнберг (P>0.1). Хомозиготният генотип AA отсъстваше при СЗ и ПЧ овце. Най-голямото генетично разстояние на Ней изчислено посредством UPGMA бе установено между популациите СПБМ и ПЧ (0.5334), а най-тясната връзка (0.0006) – между МЧШ и СПБМ. Резултатите от това изследване потвърждават наличието на единичен нуклеотиден полиморфизъм в екзон II на β-лктоглобулиновия ген. Следователно, генетичната изменчивост в този полиморфен локус може да се приложи в бъдещи асоциационни проучвания на признаците на млеконадоя при овце.

 

Ключови думи: български породи овце, β-лактоглобулинов ген, PCR-RFLP анализ, единичен нуклеотиден полиморфизъм