Kshash, Q. H. & L. A. Al-Raowf, 2020. Molecular detection and phylogenetic analysis of Mycoplasma  spp. isolated from Awassi sheep in Al-Muthana province, Iraq. Bulg. J. Vet. Med., 23, No 1, 21-28.

DOI: 10.15547/bjvm.2190

This study was carried out for molecular detection and phylogenetic analysis of Mycoplasma  spp. in Awassi sheep in Al-Muthana province, Iraq. A total of 270 milk samples and swabs were collected from infected sheep. A polymerase chain reaction (PCR) technique was performed to detect a specific 16S rRNA gene of Mycoplasma  spp. in these samples. Forty-four positive samples (16.2%) were identified, from which eight samples were selected for partial-gene sequencing. Then, alignment, comparison with referencing isolates in GenBank, and phylogenetic tree were performed using mean (UPGMA tree) in a MEGA software. The analyses revealed high homology between the current Iraqi isolates and American and Sweden Mycoplasma strains. The present molecular study showed that the studied Iraqi Awassi sheep were infected with Mycoplasma  spp. with higher detection percentage from ocular swabs than from other types of samples. The phylogenic analysis registered eight Iraqi isolates with accession numbers in the GenBank with high similarity to five referencing mycoplasma species.

Key words: Iraq, Mycoplasma, PCR, phylogeny, sequence, sheep

Kshash, Q. H. & L. A. Al-Raowf, 2020. Молекулярна детекция и филогенетичен анализ на Mycoplasma  spp. изолати от овце Аваси в провинция Ал-Мутана, Ирак. Bulg. J. Vet. Med., 23, No 1, 21-28.

DOI: 10.15547/bjvm.2190

Проучването бе проведено с цел молекулярна детекция и филогенетичен анализ на Mycoplasma  spp. изолати от овце Аваси в Ал-Мутана, Ирак. Общо 270 млечни и тампонни проби бяха получени от заразени овце. С помощта на полимеразно-верижна реакция (PCR) е установено наличие на специфичния 16S rRNA ген на Mycoplasma  spp. в пробите. Идентифицирани са 44 положителни проби (16.2%), от които осем са избрани за частично генно секвениране. След това бе извършено подравняване и сравнение с референтни изолати от GenBank, а филогенетичното дърво бе конструирано с инструменти (UPGMA tree) от MEGA софтуер. Анализите разкриха висока хомология между настоящите иракски изолати и американските и шведски щамове Mycoplasma. Това молекулярно проучване показа, че изследваните иракски овце Аваси бяха инфектирани с Mycoplasma  spp. с по-голям процент на детекция от очните тампони в сравнение от останалите видове проби. Филогенетичният анализ регистрира осем иракски изолата с идентификационни номера в GenBank, с високо сходство с петте референтни вида mycoplasma.

Ключови думи: Ирак, Mycoplasma, PCR, филогенеза, последователност, овце