Khan, W. A., T. Hussain, M. E. Babar, A. Nadeem, A. R. Awan & F. M. M. T. Marikar, 2019. Identification of novel single nucleotide polymorphisms in the PRKAG3 gene of Pakistani river buffalo. Bulg. J. Vet. Med., 22, No 3, 353–358.

DOI: 10.15547/bjvm.2131

Pakistani river buffalo is classified in five breeds out of which Kundi buffalo has been least documented. This study is designed to find single nucleotide polymorphisms (SNPs) in exonic and in-tronic regions of PRKAG3 (AMP-activated, Gamma3 non-catalytic subunit) gene in the Kundi buf-falo. The PRKAG3 gene of 95 animals each from Kundi and Nili-Ravi were sequenced for identifica-tion of novel SNPs. Comparing with the Nili Ravi breed of buffalo PRKAG3 gene, six SNP sites were identified in the Kundi buffalo. The novel SNPs found in this work can function as a genomic indicator for genetic-phenotypic relationship of PRKAG3 gene with milk and meat production in buffalo. This is the first report of SNPs in PRKAG3 gene of Kundi Buffalo.
 

Key words: AMPK, Pakistan, PRKAG3, river buffalo, single nucleotide polymorphism
 

Khan, W. A., T. Hussain, M. E. Babar, A. Nadeem, A. R. Awan & F. M. M. T. Marikar, 2019. Идентификация на нови единични нуклеотидни полиморфизми в PRKAG3 гена на Пакистанския речен бивол. Bulg. J. Vet. Med., 22, No 3, 353–358.

DOI: 10.15547/bjvm.2131

Пакистанският речен бивол има 5 породи, от които Kundi е най-слабо документирана. Проучването целеше да открие единични нуклеотидни полиморфизми (SNPs) в екзонните и интронни региони на PRKAG3 (AMP-активиран, Gamma3 некаталична субединица) ген при биволи Kundi. Генът PRKAG3 от 95 животни от породите Kundi и Nili-Ravi бяха секвенирани за идентифициране на нови SNPs. В сравнение с породата биволи Nili Ravi, в гена PRKAG3 на биволите Kundi бяха идентифицирани 6 SNP участъка. Новите SNPs открити в това проучване могат да служат като геномен индикатор за генетично-фенотипната връзка на PRKAG3 ген с продукцията на биволско мляко и месо. Това е първото съобщение за SNPs в PRKAG3 гена при биволи Kundi.
 

Key words: AMPK, Пакистан, PRKAG3, речен бивол, единичен нуклеотиден полиморфизъм